לפני השימוש במכשירי PDT, יש לקחת בחשבון את הצעדים הבאים כדי להבטיח בטיחות כמו גם תוצאות מועילות. בראש ובראשונה, יש להקפיד תמיד על ההנחיות שניתנות על ידי היצרנים לגבי כיצד יש להשתמש במכשיר, כולל משך הטיפול והמרחק מהעור. אנשים עם עור רגיש ו/או שיש להם בעיות בריאות אחרות צריכים לפנות לייעוץ רפואי לפני תחילת הטיפול. לאחר מכן, יש להגן על העיניים מפני אור חזק באמצעות משקפיים מתאימים, אך גם אז, יש להגביל את החשיפה ככל האפשר. יש לבדוק את המכשיר באופן קבוע ואם נמצאות סדקים או סימני התדרדרות, יש להשליך את המכשיר. סביבה נקייה היא גם קריטית כדי למנוע את הסיכון לזיהום. כללים פשוטים אלה יעזרו למשתמש להשיג את ההשפעות המיועדות של טיפול PDT עם מינימום סיכונים.