ก่อนที่จะใช้เครื่อง PDT ควรพิจารณามาตรการป้องกันต่อไปนี้เพื่อให้แน่ใจในความปลอดภัยและผลลัพธ์ที่เป็นประโยชน์ ก่อนอื่นต้องปฏิบัติตามแนวทางที่ผู้ผลิตกำหนดเกี่ยวกับวิธีการใช้เครื่อง รวมถึงระยะเวลาของการรักษาและระยะห่างจากผิวหนัง ผู้ที่มีผิวบอบบางและ/หรือมีปัญหาสุขภาพอื่น ๆ ควรขอคำแนะนำจากแพทย์ก่อนเริ่มการบำบัด ต่อไป ดวงตาควรได้รับการป้องกันจากแสงจ้าโดยการสวมแว่นตาที่เหมาะสม แต่ถึงอย่างนั้นการสัมผัสกับแสงควรจำกัดให้น้อยที่สุดเท่าที่จะทำได้ ควรตรวจสอบเครื่องเป็นประจำ และหากพบรอยแตกหรือสัญญาณของการเสื่อมสภาพ ควรทิ้งเครื่องนั้นไป สภาพแวดล้อมที่สะอาดก็มีความสำคัญเช่นกันเพื่อป้องกันความเสี่ยงจากการติดเชื้อ กฎง่าย ๆ เหล่านี้จะช่วยให้ผู้ใช้บรรลุผลที่ตั้งใจของการบำบัด PDT โดยมีอันตรายน้อยที่สุด