Rødt lys og nærinfrarødt (NIR) lys bruges begge almindeligvis i fotobiomodulationsapplikationer, da begge tilhører den samme kategori af lavniveau-lysterapi og bruges til lignende velvære- og restitutionsformål. De væsentligste forskelle mellem dem er begrænset til to centrale fysiske egenskaber: synlighed og penetrationsdybde.
Forskel i synlighed
Den første forskel er, om lyset kan ses af det menneskelige øje. Rødt lys ligger inden for det synlige lysspektrum, hvilket betyder, at det kan ses tydeligt under brug og typisk fremstår som en rød glød. I modsætning hertil er nær-infrarødt lys usynligt for det menneskelige øje, så det producerer ikke en synlig lyseffekt under drift. På trods af denne forskel fungerer begge typer under det samme generelle terapeutiske princip.
Forskel i indtrængningsdybde
Den anden vigtige forskel er dybden af penetrationen i kroppen. Nær-infrarødt lys er i stand til at trænge dybere ind i kroppens væv sammenlignet med rødt lys. Rødt lys virker generelt mere på overfladelagene, mens nær-infrarødt lys når dybere strukturer under huden. Denne forskel i penetrationsdybde er den primære faktor, der adskiller deres funktionelle anvendelsesområde.
Samlet set, bortset fra synlighed og penetrationsdybde, betragtes rød og nær-infrarød lysterapi som stort set de samme med hensyn til deres grundlæggende mekanisme, og mange apparater kombinerer begge bølgelængder for at give bredere dækning.